Stoppe brystkreft med hjelp fra AI

Den amerikanske regjeringen ønsker å finne ut om kunstig intelligens kan hjelpe leger med å diagnostisere og behandle brystkreft mer effektivt.



I et forsøk på å finne målrettede behandlinger for spesielt invasive typer brystkreft som ikke reagerer godt på eksisterende legemidler, kunngjorde Forsvarsdepartementet denne uken at det verver biofarmaselskapet Berg Health til å bruke AI for å oppdage medisiner. Partnerskapet støtter Det hvite hus's Cancer Moonshot-initiativ for å screene opptil 250 000 pasientprøver på jakt etter nye biologiske indikatorer, eller biomarkører, for de tidligste tegnene på kreft. Mens dødsraten fra brystkreft har falt jevnt over de siste to tiårene, er det fortsatt den nest største morderen blant krefttilfeller hos amerikanske kvinner, ifølge National Cancer Institute.

Under partnerskapet vil Berg ha tilgang til DoDs Clinical Breast Care Project, en bank med 13 600 prøver av både sunt og sykt vev fra nesten 8 000 pasienter.



En Berg-forsker bruker en sentrifuge til å behandle prøver i selskapets laboratorium. Berg har utviklet en plattform for kunstig intelligens for raskt å screene pasientvevsprøver for potensielle medikamentmål.



Berg vil starte med å sekvensere prøver fra friske givere og de med ulike undertyper av brystkreft, som vil generere genomisk og annen informasjon om mutasjoner, proteiner og cellulære prosesser som finnes i kreftceller og friske celler. Disse dataene vil deretter bli kombinert med pasientenes kjente medisinske historie og matet inn i Bergs AI-baserte plattform, som vil produsere ulike modeller av sunt og sykt vev ved hjelp av billioner av datapunkter. Plattformens algoritmer vil da hjelpe til med å oppdage mønstre – hot spots eller huber – i molekylære signaturer på tvers av disse modellene. Slike mønstre kan representere biomarkører eller legemiddelmål.

Berg starter med data og lar dataene generere hypoteser – det motsatte av prosessen som er vanlig i legemiddeloppdagelse, sier Niven Narain, Bergs medgründer, president og administrerende direktør.

Startups inkludert AtomWise, Insilico Medicine og TwoXAR tar lignende tilnærminger, og bruker spesialbygde AI-plattformer for å eliminere noe av gjetningene som er involvert i tradisjonell medisinoppdagelse.



Narain mener det finnes andre undertyper av brystkreft som forskerne ikke har identifisert ennå, og han håper Berg kan hjelpe til med å identifisere disse så vel som medikamentmål for kjente undertyper. Viktige biomarkører oppdaget under dette samarbeidet kan føre til en blodprøve for brystkreft, en mye mindre invasiv prosedyre enn biopsiene som kreves i dag.

Målrettede kreftterapier som brystkreftbehandlingen trastuzumab, kjent som Herceptin, har vist utrolig lovende, men de virker ikke på alle pasienter fordi de er designet for spesifikke genetiske mutasjoner i svulster. Omtrent 25 prosent av brystkreftpasienter har en undertype kjent som HER2 -positiv sykdom, som i noen tilfeller kan behandles effektivt med Herceptin i tidlige stadier. Men ikke alle pasienter på Herceptin reagerer på stoffet, en indikasjon på at andre biologiske faktorer spiller inn, sier Narain.

Berg har allerede brukt sin AI-plattform for å identifisere og fremme et eksperimentelt medikament som har potensial til å bremse eller reversere kreftcellevekst ved å endre en driver som antas å være involvert i forskjellige typer kreft. Utredningsmiddelet er for tiden i en fase II klinisk studie for avansert kreft i bukspyttkjertelen, i kombinasjon med et vanlig kreftlegemiddel.



gjemme seg